Первое упоминание о селе Малая Шатьма, принадлежавшее Исаковскому обществу зафиксировано в Историко-статистическом описании церкви и прихода села Малой Шатьмы Ядринского уезда, Казанской епархии составленный в 1899 году («…В настоящее время в составе прихода села Малой Шатьмы входят следующие деревни: - Исаковского общества: Тухуръ – таги, Кумагалы, Очь – касы и Пшунки; 3-е Янгильдинского общества: Пердния Кароки, Задния Кароки,
Отланы, Хозакъ – касы и Ванюшино; Байгуловского общества: Яманаки, Сирикли, Яшкильдино и Тватта – пюрть; 1 – во Янгильдинского общества: Шу – пось, Вурманъ – касы, Тоганаши и Таныши.»)
Исаково ( М. Шатьма) Кесен Шетме (Усек) 1927 г.
Уезд Ядринский с 1917 г.
Цивильский с 1 июля 1922 г. по 1927 г.
Волость Убеевская 1917 – 1927 гг.
Район Цивильский с 1 октября 1927 г.
Траковский с 1 марта 1935 г.
Исаковский сельский совет с 1 октября 1927 г.
Пшонгинский сельский совет с 1 октября 1927 г.
Яманакский сельский совет с 1 января 1918 г.
Исаковский сельский совет с 14 июня 1954 г.
Исаковская сельская администрация 1991 г.
Яманакская сельская администрация 1991 г.
Исаковское сельское поселение с 1 января 2006 г.